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凝膠遷移或電泳遷移率EMSA實驗

實驗意義

EMSA是轉(zhuǎn)錄因子研究的經(jīng)典方法。今年來基因分子生物學(xué)研究領(lǐng)域的趨勢之一是從基因結(jié)構(gòu)和功能分析轉(zhuǎn)向基因順式作用元件和反式作用因子(轉(zhuǎn)錄因子)及其轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制上，對基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的研究是表觀遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)的熱點。

實驗原理及流程

凝膠遷移或電泳遷移率檢測(Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA)是--種檢測DNA序列和蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。將純化的蛋白與細胞粗提液以及同位素標(biāo)記的DNA或者RNA探針--同孵育，然后通過非變性的聚丙烯凝膠電泳分離核酸蛋白質(zhì)復(fù)合物以及未結(jié)合的探針，核酸蛋白質(zhì)復(fù)合物(DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物或RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物)比未結(jié)合的探針遷移速度慢，從而檢測DNARNA序列與蛋白質(zhì)的相互作用。

結(jié)果展示[1,2]

實驗完成周期及交付標(biāo)準(zhǔn)

1.實驗周期: 4-7周

2.交付標(biāo)準(zhǔn): X光片、實驗報告(實驗步驟、試劑、儀器)

需確認的信息

1.目的基因與蛋白信息

2.樣本種屬及類型

3.是否提供抗體

參考文獻

[1]MillerD E , PatelZH , LuX, et al. Screening for Functional Non-coding Genetic Variants Using Electrophoretic

Mobility Shift Assay (EMSA) and DNA- afinity Precipitation Assay (DAPA)J]. Journal of Visualized Experiments Jove,

2016, 2016(114).

[2] Pares-Matos EL. Electrophoretic Mobility-Shift and Super-Shift Assays for Studies and Characterization of Protein-

DNA Complexes[M]/ Gene Regulation. Humana Press, 2013.

[3] Bak G , Han K, Kim K, et al. Electrophoretic mobility shift assay of RNA-RNA complexes [J]. Methods in Molecular

Biology, 2015, 1240:153.

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